TAG

RSS订阅

加入收藏

设为首页

当前位置:主页 > 产前DNA检测 >

从孕妇血浆中的无创性产前分子核型分析

发布时间:2014-11-16 22:09 类别:产前DNA检测

从孕妇血浆中的无创性产前分子核型分析

胎儿DNA是存在于血浆中的孕妇。大规模并行母体血浆DNA测序已经被用来检测胎儿三体21,18,13和选定的性染色体非整倍体无创性。已报告病例报告描述胎儿从母体血浆使用大规模并行测序的微缺失检测。然而,这些以前的报告或者依赖多态性或使用被限制在一个或一小部分的基因组的选定部分的统计分析。 在这份报告中,我们报道的程序执行3 MB的分辨率在整个基因组通过母体血浆DNA的大规模并行测序的无创性产前染色体核型分析。该方法已被用于分析得到的6例的等离子体。在三种情况下,胎儿微缺失已成功检测孕妇血浆。在两起案件中,被检测胎儿microduplications已经成功地从母体血浆。在剩余的情况下,的血浆DNA测序结果与怀孕的母亲是一个载体的microduplication一致。仿真分析进行了确定2 Mb和1 Mb的提高无创性产前诊断的分辨率的核型分析,将需要被测序并对齐的血浆DNA分子的数目。总之,从孕妇血浆大规模并行测序的无创性产前分子核型分析是可行的,将提高诊断光谱无创性产前测试。

母体血浆中胎儿DNA的存在开辟了令人兴奋的可能性,为无创性产前测试[2] 。近日,一直存在很大的兴趣使用大规模平行测序(MPS)分析循环胎儿DNA进行产前测试目的。因此,胎儿三体21,13,18和已选定的性染色体非整倍体检测MPS母体血浆DNA [3] - [7] ,并已迅速引入临床服务。

除了由于涉及整个染色体拷贝数变化异常,这将是重要的,以评估是否基于MPS的分析母体血浆可能不够敏感,用于检测亚染色体的缺失或重复。在这方面,彼得斯等报道在妊娠35 周的孕妇血浆样本在12号染色体上的一个4.2 Mb的缺失检测[8] 。Jensen等报道获得来自两个孕妇在母体血浆样本中,在19 世纪和20周妊娠[9] 22号染色体上删除3 MB的检测。除了 在被删除的区域,Peters等人也进行了统计分析12号染色体,以及20个不重叠的14号染色体上的4 Mb的区域[8]在另一个区域上。Jensen等,另一方面,只集中他们的统计分析对删除区域的22号染色体上的[9] 。Peters等Jensen等数据,它是不是清楚,如果该方法是将基因组的调查微缺失或microduplications,或什至一个胎儿染色体核型为无创性测定足够强大。

Lo等人报告说,胎儿的单核苷酸多态性(SNPs)可以利用母体血浆DNA测序全基因组规模的基因分型[10] 。特别是,这些调查表明,SNP等位基因突变的胎儿从母体所继承的单基因疾病,可以阐明这个过程被称为相对单倍剂量分析[10] 。Fan等人证实相对的单倍型剂量分析的鲁棒性,并用这种方法来检测约2.85 MB胎儿从母亲继承[11]删除。使用这种方法的临床实施无创性产前染色体核型分析有两个弊端。首先,这种方法需要要执行的产妇单体型,这将需要额外的分析步骤[12] ,[13]或系谱分析。第二,它是不清楚的,如果该方法可用于检测从头亚染色体缺失或重复。

我们最近表明,通过使用的癌症患者的血浆DNA的鸟枪MPS,可以非侵入性地获得等离子体核型的癌症分辨率以1 Mb T[14] , [15] 。在这份报告中,我们试图采用类似的方法,取得了一批猎枪MPS母体血浆DNA胎儿的产前分子核型。